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2006年10月16日星期一

设计简并引物的方便工具GeneFisher

GeneFisher

是一个设计简并引物(degenerate PCR Primer)的方便工具,只要把几条序列(DNA或蛋白序列)按fasta格式贴进去,然后按提交,第一步程序先检验序列是否可用,如果可用再下一步提交做multiple sequence alignment,可以选用ClustalW 或 DCA,做alignment可以设置一些参数,不懂的话直接用默认的,比对之后容许你检查比对得出的保守序列,如果没问题在此结果上做设计引物,设计引物的时候也可以修改参数,这一步用过Primer Premier 5的朋友肯定都会。一般要放宽一些条件,否则容易得不出结果。

好不好用你去试用才知道。

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